Mientras, el capitán Roberto continuaba trabajando directamente con el presidente Molina. El mandatario lo había rescatado de su estigma medranista y su indisciplina la saldaba con el estilo de militar huevudo que lo caracterizaba. A menudo se le miraba salir del despacho del ministro de defensa general Romero Mena, un anticomunista de hueso colorado que no pispileaba cuando daba órdenes de aniquilar a los opositores. En cuestiones de poder militar era quien mandaba realmente en el ejército y por tanto era el ungido de la oligarquía para el próximo periodo presidencial. El primero que se opuso a la reforma agraria de Molina fue su ministro de defensa, general Romero Mena. Un día que se despedían, Romero Mena le dijo al subalterno, entonces, chele, así quedamos, y el capitán cuadrándose muy erguido, sonando fuerte los talones y saludando marcialmente con la mano derecha en el parietal, contestó, así quedamos mi general.

El coronel Arturo Armando Molina Barraza había llegado a la presidencia de la república por medio de un fraude electoral que provocó el levantamiento de algunos militares, que luego de intentar un golpe de estado fueron reprimidos y exiliados. Con el gobierno de Molina inició un periodo de violencia e insurrección que cobró forma en el gobierno posterior de Romero Mena. Según registros históricos, el presidente Molina ha sido el mandatario salvadoreño sobre el cual la musa popular ha creado más chistes burlándose de su torpeza, aunque algunos sostienen que los chascarrillos los inventaba o recopilaba el escritor Waldo Chávez Velasco como estrategia de comunicación para darle atole con el dedo al pueblo. Waldo Chávez fue secretario particular y secretario de información en los gobiernos de Sánchez Hernández y Molina. Cuando Molina quiso establecer su proyecto de reforma agraria, dijo públicamente que ante aquella decisión no daría un paso atrás, pero cuando la oligarquía le obligó a desistir de aquella insensata reforma, el chiste fue que no dio un paso, sino que pegó una gran carrera hacia atrás.

El general Romero Mena sabía lo que se avecinaba y era cosa entonces de preparar las condiciones en las filas del ejército. Para ello necesitaba cuadros como Roberto a quien el 2 de febrero de 1976 Molina transfirió de nuevo a la Guardia Nacional como comandante de la compañía de Instrucción. Ese mismo año estudió el primer curso en la Escuela de Comando y Estado Mayor. El 31 de diciembre fue ascendido al grado de mayor. En noviembre de 1977 Roberto se diplomaba como oficial del Estado Mayor con lo cual quedaba apto para comandar grandes unidades militares. Ahora entiende mejor de geopolítica, sociología, ciencias jurídicas y estrategia militar. Por primera vez escucha sobre El Arte de la Guerra del chino Sun Tzu cuyos principios se pueden aplicar a hechos de la vida cotidiana, y vuelve a escuchar sobre los principios de la guerra de Karl Clausewitz que había escuchado en la academia. Algunos profesores de inteligencia hacían alusión sobre los cambios que para mal se efectuaban en la doctrina de la iglesia católica, refiriéndose a Vaticano II y Medellín como focos de desestabilización.